产品介绍

     基于随机引物的策略方法，可以实现全样本类型、全物种、全长单细胞转录组研究，并且大幅度提高了单细胞测序的基因检出数，将极大拓宽单细胞技术的应用领域。

产品特点

    可在单细胞水平准确鉴定基因的可变剪接、可变多聚腺苷酸化（alternative polyadenylation, APA）、融合基因、基因家族和非编码RNA等信息。

实验方法

     通过高通量的单细胞转录组试剂盒、单细胞制备仪、分析软件组成的完整平台，可实现对每个样本1000-20000个细胞进行全长无偏差的转录组检测，并进行mRNA、非编码RNA等研究。使用阻断引物与裸露的单链DNA结合，通过多次退火和延伸进行原位阻断。然后，随机引物和oligo（dT）引物进入细胞核与RNA结合，对全转录组的RNA分子进行原位逆转录。通过末端转移酶（TdT）将 Poly（dA）原位添加到cDNA的3’末端。之后，基于单细胞平台进行高通量单细胞核标记。最后，进行纯化、cDNA扩增、文库构建以及测序分析。

分析内容

      细胞鉴定及基因表达定量、细胞亚群分析、APA分析、转录本融合发现、特征基因注释、特征基因功能富集分析、蛋白调控网络分析、转录因子分析、细胞周期分析、拟时序分析、RNA速度分析、细胞通讯分析、GSEA分析、肿瘤拷贝数变异分析、加权基因共表达网络分析。

分析结果示例图