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全长微生物多样性

组学测序

全长微生物多样性

产品介绍

全长微生物多样性测序是一种基于三代PacBio测序平台的高通量测序技术,它利用单分子实时测序(SMRT Cell)的方法对微生物的标记基因(如细菌的16S rRNA基因、真菌的ITS区域)进行全长测序。这种技术能够提供更全面的微生物群落结构信息,包括物种组成、基因功能和代谢通路等,从而更真实地还原样本中的微生物群落结构。


产品特点

1、覆盖度广、读长长、通量高、物种注释准确:Pacbio全长微生物多样性测序技术结合了一代Sanger测序的读长优势和Illumina测序的高通量优势,能够将细菌16S全长和真菌ITS全长完全测通,在细菌、真菌群落结构分析中具有显著优势。

2、超高准确性:PacBio测序平台CCS模式,minPasses≥5,能够提供超高准确性的测序结果。

3、种水平注释:承诺注释到“种”水平,种水平注释平均注释率≥60%,告别挑选测序引物的纠结时代,开启种水平鉴定“新纪元”。

4、全长序列信息:全长序列中携带的特征信息更多,支持“种”水平的分辨率,避免了短读长扩增子的PCR引物选择会影响推断的群落准确性和某些细菌类群的敏感性。

5、CCS扩增子测序模式:结合DADA2软件算法,可获得单碱基/近零错误率的全长rRNA基因序列。

6、更高的数据质量:PacBio CCS自我矫正模式可获得高质量的数据。

7、更高的比对率:注释到各分类水平的序列比对率更高。

8、更高的分辨率:16S全长序列分析到种分类水平。


分析内容

结果展示

送样建议

1.动物组织>0.3g,核酸不丰富部位,例如脂肪、成熟皮肤、骨头等部位建议增加送样量。
2.动物血液(哺乳类)>1mL;动物血液(红细胞有核类)> 0.5mL,血清血浆需酌情增加送样量。
3.唾液>4mL。
4.菌液(对数生长期)>4mL;菌体:对应菌液离心后菌沉淀30-50µL;真菌菌丝>0.5g。
5.土壤:固体2g,液体2mL。
6.粪便、肠道内容物、食糜≥1mL(离心管刻度);瘤胃液>2mL,胃液有浑浊,离心送沉淀为佳。
7.水体(滤膜):直径4cm,滤膜3张,如果菌群丰度较低,建议增加送样量。
8.拭子>4个,拭子表面有明显颜色变化,达到富集微生物的目的。