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真菌HI-C

组学测序

真菌HI-C

产品介绍

真菌染色体构象捕获(Chromosome Conformation Capture,Hi-C)能够帮助科学家在三维空间中解析真菌染色体的结构。其工作原理是基于交联剂将空间上相互靠近的DNA片段固定,然后通过酶切、连接等一系列复杂的生物化学步骤,构建出能够反映染色体三维结构的文库。这些文库可以通过高通量测序技术进行分析,从而获得真菌染色体不同区域之间的相互作用信息。通过构建真菌染色体结构的进化图谱,探索在真菌进化过程中染色体结构的变化规律,以及这些变化如何影响真菌的生物学特性,如致病性、环境适应性等。


产品特点

1、高分辨率:真菌HI - C能够提供高分辨率的染色体三维结构信息。它可以精细地描绘出真菌染色体上不同基因位点之间的相互作用,精确到几千个碱基对的级别。

2、全基因组覆盖:该技术能够覆盖整个真菌基因组,研究人员可以全面了解基因组在三维空间中的组织方式,发现基因组中的远程相互作用和染色体间的相互作用。

3、多维度信息整合:真菌HI - C的数据可以与其他多种组学数据进行整合。例如,结合基因表达数据、染色质修饰数据等,能够构建出一个更加完整的真菌基因组功能图谱。当把HI - C数据与基因表达数据整合时,可以分析染色体结构变化与基因表达水平变化之间的相关性。以在不同生长阶段的真菌为例,通过整合这两种数据,可以观察到在菌丝生长和孢子形成阶段,染色体结构的动态变化如何影响相关基因的表达,从而揭示真菌生长发育过程中的基因调控网络。


结果展示


送样建议

单细胞真菌:显微镜下观察酵母菌生长状态,尽量收集生长期处于对数期的酵母菌;将适量体积的酵母菌液转移至将2mL旋盖尖底离心管中(无菌,无核酸酶),于室温下14000×g 离心1min;弃尽培养基,将酵母细胞沉淀迅速置于液氮中冷冻3h以上,然后转移至-80 °C长期保存。

大型真菌:从菌体上,取下生长旺盛的组织,用无菌水冲洗干净,再使用 75%乙醇冲洗,用吸水纸吸干样品表面;如果组织体积较大,应尽量将组织剪切成长宽高均≤0.5cm 的小块;将处理好的组织样本保存于2ml 或更大体积的旋盖冻存管中或者用准备好的锡箔纸包裹组织

保存及运输:样本-80 °C或液氮中长期保存,干冰运输