分析目的

越来越多的证据表明，肿瘤微环境(免疫细胞浸润)在肿瘤的发生和发展中起着重要作用，并且还可以影响患者的预后。肿瘤免疫微环境是揭示肿瘤及亚型异质性和患者不同预后和治疗反应的重要因素。

数据来源

自测数据或公共数据库里的转录组数据。

分析方法
通过分析肿瘤样品的免疫和基质评分以检测差异表达基因，筛选肿瘤微环境中的关键预后基因，并构建了肿瘤微环境相关的预后模型。首先，从TCGA数据库获得了肿瘤患者的mRNA-Seq和相关临床信息，并使用ESTIMATE算法计算了肿瘤组织的基质和免疫评分。然后，进行功能富集分析，并从与肿瘤微环境高度相关的差异基因中生成了蛋白质-蛋白质相互作用网络。最后，对TCGA的肿瘤数据集进行Cox比例风险回归分析，并对浸润的免疫细胞和人类蛋白质图谱进行分析。

分析内容
（1）差异表达基因的鉴定、每个样本的各类免疫细胞组分
（2）肿瘤 vs 对照的免疫细胞组分差异表达分析

分析结果示例图