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Hi-C测序

组学测序

Hi-C测序

产品介绍

Hi-C测序即高通量染色体构象捕获技术测序,是一种用于研究全基因组范围内染色质DNA在空间位置上的关系,进而获得高分辨率染色质三维结构的技术,通过甲醛交联使染色质内的DNA与蛋白质之间、DNA与DNA之间的相互作用固定,然后用限制酶切割染色质,使DNA片段化,接着在稀释条件下将末端连接,形成包含不同基因组位点相互作用信息的嵌合DNA分子,再经过纯化构建文库,最后利用高通量测序技术对文库进行测序,并结合生物信息分析方法,将测序得到的读长定位到基因组上,构建出全基因组范围内的染色质相互作用图谱,从而揭示染色体的三维结构以及基因在细胞核内的空间组织和调控关系。

产品特点

全面性:Hi-C测序能够在全基因组范围内捕获染色质DNA的相互作用,提供整个基因组的三维结构信息,而不是局限于特定的基因或区域,有助于全面了解基因组的空间组织和基因调控网络。

高分辨率:随着技术的不断发展和改进,Hi-C测序的分辨率不断提高,可以检测到更精细的染色质结构和相互作用,如拓扑相关结构域(TADs)、染色质环等,能够深入解析基因与基因之间、基因与调控元件之间的空间关系,为研究基因调控机制提供更准确的信息。

多维度信息整合:Hi-C数据可以与其他组学数据,如转录组数据、Chip-seq数据等进行整合分析,从而更全面地阐述生物体性状形成的相关机制。例如,结合转录组数据可以研究染色质三维结构对基因表达的影响,整合Chip-seq数据可以探究蛋白质结合与染色质构象变化之间的关联。

分析流程

结果展示

送样建议

环境样品送样要求(浓度≥20ng/ul,总量≥3ug )保存及运输
单细胞真菌显微镜下观察酵母菌生长状态,尽量收集生长期处于对数期的酵母菌;将适量体积的酵母菌液转移至将2mL旋盖尖底离心管中(无菌,无核酸酶),于室温下14000×g 离心1min;弃尽培养基,将酵母细胞沉淀迅速置于液氮中冷冻3h以上,然后转移至-80 °C长期保存样本-80 °C或液氮中长期保存,干冰运输
大型真菌从菌体上,取下生长旺盛的组织,用无菌水冲洗干净,再使用 75%乙醇冲洗,用吸水纸吸干样品表面;如果组织体积较大,应尽量将组织剪切成长宽高均≤0.5cm 的小块;将处理好的组织样本保存于2ml 或更大体积的旋盖冻存管中或者用准备好的锡箔纸包裹组织