IF:6.3,院士团队单基因泛癌分析+实验验证,揭示Pleckstrin-2在肿瘤进展和免疫调节中的作用!
题目:揭示Pleckstrin-2在肿瘤进展和免疫调节中的作用:来自以肺癌为重点的全面泛癌分析的见解
英文名:Unveiling the role of Pleckstrin-2 in tumor progression and immune modulation: insights from a comprehensive pan-cancer analysis with focus on lung cancer
杂志:Molecular Biomedicine
影响因子:6.3/Q1
发表时间:2024年11月15日
研究背景:癌症仍然是全球死亡的主要原因,这凸显了新型生物标志物来增强预后和治疗策略的必要性。Pleckstrin-2(PLEK2)是pleckstrin家族的一员,与肿瘤进展的关键过程有关,但其在癌症中的作用仍未得到充分探索。
研究思路:本研究系统地检查了PLEK2在多种癌症类型的表达模式、预后相关性和功能影响。使用TCGA)、GTEx和人类蛋白质图谱的数据,分析了癌组织和正常组织中PLEK2的表达,揭示了PLEK2在各种癌症中在mRNA和蛋白质水平上的显著过表达。单细胞RNA测序进一步表明PLEK2在肿瘤微环境中的肿瘤细胞和巨噬细胞中占主导地位。生存分析表明,PLEK2表达升高与特定癌症的不良预后相关,尽管其影响因癌症类型而异。功能测定显示PLEK2敲低抑制人癌细胞系的增殖和迁移。使用Lewis肺癌(LLC)模型的体内研究证实,PLEK2敲低抑制了肿瘤生长并增强了PD-1免疫疗法的疗效。从机制上讲,PLEK2敲低与AKT通路激活减少、肿瘤相关巨噬细胞浸润减少和CD8T细胞存在增加有关。Navitoclax等化合物也被确定为潜在的PLEK2抑制剂。总之,PLEK2在癌症进展和免疫反应调节中发挥多方面作用。靶向PLEK2可能会抑制肿瘤生长并克服免疫治疗耐药性,为改善癌症治疗结果提供有前途的生物标志物和治疗靶点。
研究结果:
1、PLEK2 在多种癌症中的表达
如图1a所示,PLEK2 mRNA在容易发生癌症发展的多个器官中显着升高,而在心脏和大脑等非增殖组织中观察到较低的表达水平。除ACC、SKCM、TGCT、DLBC、LIHC和PCPG外,大多数癌症中PLEK2表达显著升高(图1b)。如图1c所示,与正常组织相比,PLEK2蛋白在几种癌症中显著上调,包括BLCA、BRCA、CESC、COAD、GBM、HNSC、LUAD、OV、PAAD、STAD和UCEC。使用HPA数据检查了PLEK2的亚细胞定位,发现它主要定位于囊泡和细胞质中(图1d)。此外,对癌细胞系的分析表明PLEK2在特定癌症类型中的表达升高,例如消化系统、膀胱、头颈部、宫颈、甲状腺、肺、胸膜间皮瘤和乳腺癌(图1e)。总体而言,这些发现表明PLEK2在各种癌症中过度表达,并可能在肿瘤发生中发挥重要作用,突出了其作为临床诊断标志物的潜力。
图1
2、PLEK2 在多个肿瘤组织中的单细胞表达水平
如图2a所示,热图说明了PLEK2在35种细胞类型中的相对表达水平,表明其广泛存在于各种免疫和恶性细胞中。图2b和c显示PLEK2在CD4T细胞、CD8T细胞、NK细胞和B细胞中的表达,在巨噬细胞中观察到特别高的表达。如图2d、e所示,在所有数据集中,PLEK2在单核细胞/巨噬细胞和肿瘤细胞中的表达升高表明PLEK2可能在肿瘤免疫中发挥重要作用。
图2
3、PLEK2 在泛癌中的预后意义
在LUAD和PAAD中,PLEK2表达升高与OS、PFS、DSS和DFS降低显著相关(图3a-d)。具体来说,PLEK2表达升高与ACC、LGG和UVM中不利的OS相关(图3a)。PLEK2表达升高对应于ACC、LGG、LUSC、SARC和UVM中PFS缩短(图3b)。此外,PLEK2表达增加与ACC、LGG、LIHC、LUSC和UVM中较差的DSS相关(图3c)。Cox比例风险模型分析显示,PLEK2表达水平与PRAD、READ和SARC中的DFS显著相关(图3d)。
图3
4、PLEK2 在癌症免疫治疗反应中的预测潜力
TIDE评分与几种恶性肿瘤中的PLEK2表达呈正相关,特别是在TGCT、GBM、LUAD、LUSC、PCPG、LGG、MESO和HNSC(图4a)。相反,在KICH、LIHC、STAD、THCA和UCEC中,低PLEK2表达的患者表现出更高的TIDE评分,也表明免疫治疗的益处降低(图4b)。PLEK2表达升高与免疫治疗缺乏反应相关,因为无反应组的患者表现出比有反应组更高的PLEK2水平(图4c)。这些发现共同表明,PLEK2表达升高可能与某些癌症的免疫治疗耐药性密切相关。
图4
5、PLEK2 与癌症免疫学特征之间的关联
PLEK2表达与ACC、CESC、GBM、KIRC、LUAD、OV和PRAD中的高MSI评分呈负相关。相反,它与COAD、SARC、STAD和TGCT中的高MSI评分呈正相关(图5a)。此外,PLEK2表达与TMB在PRAD中呈负相关,而在COAD、ESCA、LGG、PAAD、SARC、STAD和UCS中观察到正相关(图5b)。这些结果表明PLEK2可能作为这些癌症中癌症免疫治疗疗效的预测标志物。PLEK2表达升高与几种关键免疫检查点分子的表达增加显著相关,如CD276(B7-H3)、CD274(PD-L1)、LGALS9、PVR(CD155)和FAS在广泛的癌症谱中(图5c)。如图5d所示,PLEK2表达与癌症相关成纤维细胞(CAFs)、CD4T细胞、巨噬细胞和自然杀伤细胞(NK)的浸润呈正相关,但与CD8T细胞和B细胞呈负相关。
图5
6、PLEK2 的GSEA分析及其对免疫治疗和药物敏感性预测的影响
GSEA分析结果揭示了免疫相关通路中不同的表达模式,特别是那些涉及抗原加工和提呈、自身免疫性甲状腺疾病、RIG-like受体信号传导和Toll-like受体信号传导通路的通路(图6a)。Plek2表达水平指示了4T1、T22(乳腺癌)和CT26(结直肠癌)小鼠模型如何对靶向PD-L1和CTLA-4的免疫治疗做出反应(图6b)。癌症药物敏感性基因组学数据集分析确定Navitoclax、甲氨蝶呤和YM201636是显示与PLEK2表达呈正相关的top-level化合物(图6c)。
图6
7、PLEK2 敲低抑制多种癌细胞中的细胞增殖和迁移
为了进一步阐明PLEK2在肿瘤细胞中的功能作用,在各种人类癌细胞系中进行了瞬时siRNA介导的PLEK2敲除,通过qRT-PCR和Western blot进行了验证(图7a-i)。在测试的两种siRNA构建体中,Si2与Si1相比表现出优越的敲除效率,qRT-PCR结果证明了这一点。使用适当的测定方法评估了PLEK2敲除对细胞增殖的影响,并观察到在测试的九种细胞系中的七种中明显抑制增殖,PLEK2敲除仅导致细胞增殖略有减少。此外,细胞迁移测定显示PLEK2敲除显著抑制所有九种癌细胞系的迁移(图7a-i)。这些发现强调了下调PLEK2阻碍了多种癌症类型的细胞增殖和迁移。
图7
8、Plek2 在LLC模型中促进肿瘤生长并影响PD-1免疫治疗的疗效
生成了稳定的Plek2敲低和过表达LLC细胞系(图8a),并进行了体外检测,以评估Plek2调制对增殖和迁移的影响。如图8b所示,Plek2敲低在移植后第14天显著降低了肿瘤生长速率和肿瘤重量,而Plek2过表达显著增加了两者(图8c)。这些发现强调了Plek2在肿瘤发展和进展中的关键作用。蛋白质印迹分析显示,Plek2组合式降低了AKT水平,并在丝氨酸473处磷酸化AKT(图8d),表明Plek2组合式与AKT途径抑制之间存在关联。与对照组相比,Plek2 组合式和 PD-1 抗体治疗的组合显着抑制了肿瘤生长速率和重量(图 8i-j)。
图8
总结:本文综合泛癌分析表明,PLEK2在癌症进展和免疫调节中发挥多方面作用。文章方法易复现,傲星生物不仅具有丰富的分析经验、还提供完善的下游验证、机制研究服务,一对一专属服务为您排忧解难,助您轻松应对毕业和晋升!